Количество налоговых проверок в 2026 году кратно выросло. Почти всегда по их результатам от компаний требуют уплаты доначислений по налогам, основанием для чего может стать необоснованное, по мнению налоговой службы, использование льготных режимов. ИТ-компании не стали исключением.
- 1. Введение
- 2. О каких льготах речь?
- 3. Когда ИТ-компания может лишиться льгот
- 4. Можно ли вернуть льготы?
- 5. Можно ли оспорить доначисления?
- 6. Выводы
Введение
В начале августа 2026 года президент Российского союза промышленников и предпринимателей (РСПП) Александр Шохин заявил о кратном росте количества налоговых проверок, особенно в крупных компаниях. По его словам, при выездной налоговой проверке инспекция вправе проверить 3 налоговых периода, предшествующих её назначению, поэтому итоговые начисления могут оказаться очень значительными.
Еще один риск связан с инвестиционными налоговыми льготами. Крупные компании, реализующие масштабные проекты, могут их получать, однако налоговые органы нередко проверяют, не были ли условия для льготы созданы искусственно. Если инспекция приходит к выводу о намеренном получении необоснованной налоговой выгоды, дополнительно начисляется штраф в размере 40%.
ИТ-компании также становятся объектами налоговых проверок и сталкиваются с доначислениями налогов. Обычно основанием для этого является неправомерное, по мнению сотрудников Федеральной налоговой службы, использование льгот.
Основатель юридической компании Future Legal (Будущее право), член комитета Торгово-промышленной палаты РФ по предпринимательству в сфере медиакоммуникаций Павел Катков обратил внимание на то, что у льгот для ИТ есть своя специфика. Раньше они распространялись на всех, кто докажет, что подходит под определение ИТ-компании, но затем ФНС стала действовать через специализированный реестр.
Правительство осенью 2025 года отказалось от масштабного свёртывания льгот для ИТ, включая освобождение от уплаты НДС при продаже реестрового ПО. Это привело бы к росту налоговой нагрузки на ИТ-компании до семь раз. Власть тогда услышала доводы отраслевых ассоциаций. В итоге всё же был сохранён налог на прибыль в 5% и удвоение страховых выплат на сотрудников до 15%.
Но налоговые органы в полной мере используют основания для возможного лишения ИТ-компаний льгот в ходе налоговых проверок. И такие возможности у них действительно есть.
О каких льготах речь?
Меры поддержки отрасли реализуются в России с 2011 года. Тогда право на налоговые льготы получили около 1,5 тыс. компаний, аккредитованных в Минкомсвязи. В 2018 году началось субсидирование разработок.
Целый комплекс мер поддержки ИТ-отрасли был принят в пандемийном 2020 году. В 2022 году фиксировали максимальное количество мер поддержки российских ИТ-компаний (правительство выделило 21,5 млрд рублей). Как отмечали отраслевые ассоциации, основную часть этой поддержки получили внутренние ИТ-структуры крупных компаний и холдингов через индустриальные центры компетенции (ИЦК).
Также в 2022 году налоговые льготы были расширены, а критерии их получения смягчены. Налог на прибыль для многих компаний был обнулён. Сотрудники аккредитованных ИТ-компаний получили отсрочку от военной службы и право на ипотеку по льготной ставке.
Но уже в 2024 году господдержка начала сворачиваться. Как заявила председатель правления Ассоциации разработчиков программных продуктов (АРПП) «Отечественный софт» Наталья Касперская, из 38 наиболее востребованных мер поддержки 16 фактически не действовали. В том же году была прекращена выдача ИТ-ипотеки в Москве и Санкт-Петербурге. В 2025 году сохранилось освобождение от налога на добавленную стоимость (НДС) при продаже ПО из реестра Минцифры.
В мае 2026 года появилась информация и о новых мерах поддержки отрасли, которые разрабатывает Минцифры. Они предусматривают прямое финансирование затрат на внедрение российского ПО в случае особо значимых проектов (ОЗП). С другой стороны, последние две волны заявок на включение проектов в перечень особо значимых были полностью отклонены. Также многие компании оттолкнули от участия в ОЗП весомые штрафные санкции за возможные нарушения.
Кроме того, Минцифры сообщает о росте объёмов ИТ-ипотеки. В 2026 году ведомство обещало выдать 11 тыс. таких кредитов. Это на треть больше уровня 2025 года.
Когда ИТ-компания может лишиться льгот
Как предупреждает юридическая компания «Ветров и партнёры», для лишения налоговых льгот для ИТ-компаний достаточно выполнения хотя бы одного из условий статей 427 или 284.1 (пункт 1.15) Налогового кодекса РФ:
- Снижение доли профильных доходов ниже порогового значения в 70%.
- Снижение количества сотрудников до шести и меньше.
- Утрата аккредитации в Минцифры.
- Реорганизация с нарушением условий правопреемства при слиянии, присоединении или разделении.
- Продажа продуктов, исключенных из реестра российского ПО (теряется освобождение от уплаты НДС).
Информация о каждом из таких событий поступает из различных ведомств в ФНС автоматически, что даёт ей право доначислить разницу по всем налогам за все периоды.
Одной из наиболее распространённых причин потери льгот называют непрохождение аккредитации в Минцифры. В 2026 году, по данным ведомства, в зоне риска оказались около трёх тысяч компаний. Министерство даже продлило в текущем году срок аккредитации на месяц.
Работа по подтверждению аккредитации закончится 22 сентября, и после этой даты количество компаний, которые её лишились, определится окончательно. Именно тогда стоит ожидать волны налоговых проверок.
Рисунок 1. Возможные основания для потери аккредитации Минцифры
В 2026 году порядок аккредитации изменили. В частности, компании при достижении оборота в один млрд рублей обязали оказывать содействие учебным заведениям и реализации профориентационных программ. Причём это требование оказалось довольно трудновыполнимым. Как сообщили «Ведомости», по состоянию на конец марта совместные программы с вузами реализовала лишь пятая часть компаний, которые подпадают под такое требование. Также Минцифры угрожало лишением аккредитации тем компаниям, которые не ограничат доступ к своим продуктам пользователям с включенным VPN, что также не всегда легко выполнимо и требует значительных инвестиций.
С другой стороны, часть компаний как минимум задумывается о том, чтобы отказаться от аккредитации в Минцифры. Это касается прежде всего резидентов Сколково и других инновационных центров, технопарков или территорий опережающего развития. Соответствующие льготы для таких компаний могут быть более весомыми, чем те, что даёт аккредитация в Минцифры.
Довольно распространённый риск связан также с последствиями реорганизации с неправильно проведенным правопреемством. Даже преобразование компании из ООО в АО влечёт смену ОГРН и ИНН, и с точки зрения закона она уже становится другой организацией. Соответственно, ей необходимо заново получать аккредитацию в Минцифры, которая даёт право на льготы. На это отводят месяц.
В одном из околоюридических блогов порекомендовали в данном случае задействовать сразу два сценария: подготовить документы на новую аккредитацию и направить сообщение в Минцифры о сохранении аккредитации, поскольку профиль компании не изменился. Через две недели аккредитация новой компании была подтверждена. Однако такие заявки ведомство не всегда может рассматривать быстро.
Значимость такого фактора, как реорганизация, со временем будет расти. Это связано с тем, что в ближайшие годы усилятся процессы, связанные со слияниями и поглощениями. А в ходе таких процедур только основная компания, которая поглощает другую, сохраняет свои реквизиты.
Компания «Ветров и партнёры» в качестве значимого фактора риска также называет снижение доли доходов от профильной деятельности ниже порогового значения в 70%. Постригайло называет этот повод для проверок одним из наиболее частых.
Можно ли вернуть льготы?
Утрата льгот, как напоминает «Ветров и партнёры», не является необратимой. Компания при условии устранения нарушений имеет право полностью их вернуть, и они снова начнут действовать в следующем отчётном периоде. Но проще ситуацию не доводить до крайностей.
«Оспаривать решение имеет смысл, если компания может нормально объяснить свою позицию и подтвердить её документами. Если спор идёт о том, как были оформлены работы или применялась льгота, шанс есть. Если ошибка действительно была, спорить уже намного сложнее», – подчеркнул старший партнёр интегратора «Энсайн» Алексей Постригайло.
В «Ветров и партнёры» обратили внимание на то, что ФНС понимает профильный доход очень узко, и сопутствующие сервисы – консалтинг, обучение, техническую поддержку без передачи прав на ПО – в этот перечень не включает, тогда как компании включают их в доходы от ИТ. Суды по таким делам ИТ-компании, как правило, проигрывают.
Довольно много споров также связано с ситуациями, когда ФНС считает, что компания ведёт не разработку своего ПО, а занимается перепродажей чужого. Тут важным аргументом может стать наличие профильного подразделения и документально подтверждённого процесса создания или разработки ПО. Как обратил внимание Павел Катков, среди льготополучателей действительно могут быть компании, не являющиеся ИТ-бизнесом, и ФНС ставит своей целью выдавить таких не вполне добросовестных игроков из льготного поля.
К другим распространённым ошибкам юристы отнесли манипуляции с численностью сотрудников накануне отчётных дат. Таким образом пытаются обходить исключение из реестра Минцифры (порог – семь человек).
Помимо этого не все компании отслеживают исключение своих продуктов из реестра российского ПО, и в результате теряют освобождение от НДС. В 2026 году Минцифры усилило проверки компаний на предмет возможных нарушений, и количество таких прецедентов растёт. Особое внимание ведомство уделяет облачным сервисам, программно-аппаратным комплексам и инструментам поддержания ИБ. Поводов для исключения из реестра довольно много, они связаны с иностранным происхождением отдельных компонентов, превышением доли нерезидентов среди учредителей компании, а также жалобами, например, на нарушение авторских прав.
Рисунок 2. Причины исключения ПО из реестра Минцифры
Можно ли оспорить доначисления?
Существует мнение, что доначисления со стороны налоговых органов невозможно оспорить. Но это не так. Как отмечается в корпоративном блоге юридической компании «МЭФ LEGAL», часто налоговые органы допускают ошибки. Их решения не всегда безупречно обоснованы. Нередко ФНС делает выводы на основании неполных данных, неправильного толкования норм НК РФ или формальных нарушений.
С другой стороны, как отмечает Павел Катков, оспорить доначисления становится всё сложнее. И тут всё зависит от качественной работы юристов на всех стадиях. По итогам 2025 года удовлетворяется около четверти жалоб на действия налоговых органов. Эта доля заметно выросла, в 2024 году удалось оспорить лишь одну шестую от назначенных доначислений налогов.
На представление возражений отводится один месяц с даты получения акта согласно статье 100 Налогового кодекса. За это время необходимо успеть проверить требования о доначислениях на наличие ошибок (например, арифметических), собрать все документы, доказывающие правомерность получения льгот, и подготовить юридическое обоснование своей позиции. Причём каждое возражение в адрес ФНС требует перечисления доказательств.
Жалоба на действия сотрудников ФНС подаётся в вышестоящий налоговый орган, но через налоговый орган, чьё решение обжалуется. То есть жалоба направляется в адрес налогового органа, вынесшего оспариваемое решение, и именно он направит её в вышестоящий налоговый орган (п. 1 ст. 139 НК РФ). Подача возражений приостанавливает процедуру взыскания, но не освобождает от обязанности контролировать сроки по выплатам. Это можно сделать в произвольной письменной форме заказным письмом или через сайт ФНС.
При несогласии с решением регионального управления налогоплательщик вправе подать жалобу в центральный аппарат ФНС России. На это отводится три месяца. Если обращение не привело к нужному результату, можно обратиться в арбитражный суд. Срок составляет три месяца с даты получения решения либо с даты, когда заявитель узнал о нарушении своих прав. Решение арбитражного суда можно оспорить в высшей инстанции вплоть до Верховного суда России.
Несколько примеров приведены на сайте компании «СКБ Контур». В них компаниям удалось полностью или частично отменить налоговые доначисления, вынесенные налоговыми органами в ходе проверок. Впрочем, эти компании не из сферы ИТ, а претензии ФНС были связаны якобы с тем, что сделки с контрагентами были фиктивными.
Выводы
ФНС действительно заметно активизировала усилия по сбору налоговых платежей. Риск столкнуться с выездной проверкой более чем реален для любой крупной компании из любой отрасли, в том числе ИТ.
Лучшим способом избежать налоговых доначислений является проактивный подход. Необходимо не допускать ситуаций, чреватых потери права на льготы. Также стоит (при наличии оснований) обжаловать решения налоговых органов. Шанс на это, как показывает реальная статистика, не так уж мал.
